Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX4Q9UIU6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX4Q9UIU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms