Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA3Q9UI47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms