Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMPXQ9UHP9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMPXQ9UHP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPXQ9UHP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms