Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX20Q9UHI6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX20Q9UHI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX20Q9UHI6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX20Q9UHI6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX20Q9UHI6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX20Q9UHI6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX20Q9UHI6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms