Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3BQ9UH17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3BQ9UH17 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3BQ9UH17 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms