Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT8Q9UFF9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT8Q9UFF9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms