Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA6Q9UF33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA6Q9UF33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms