Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REV1Q9UBZ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REV1Q9UBZ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REV1Q9UBZ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms