Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVK-18Q9QC07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-18Q9QC07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms