Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH4Q9P2E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH4Q9P2E8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH4Q9P2E8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms