Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHPF2Q9P2E5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHPF2Q9P2E5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms