Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNT4Q9P109 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNT4Q9P109 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms