Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms