Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SENP1Q9P0U3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SENP1Q9P0U3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms