Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFA13Q9P0J0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms