Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBP1Q9NZI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBP1Q9NZI7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms