Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF38Q9NXL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF38Q9NXL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms