Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDL2Q9NX52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDL2Q9NX52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms