Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDFIP2Q9NV92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDFIP2Q9NV92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms