Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GKN1Q9NS71 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKN1Q9NS71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms