Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHK2Q9NRA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHK2Q9NRA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHK2Q9NRA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPHK2Q9NRA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPHK2Q9NRA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPHK2Q9NRA0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms