Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM7Q9NQW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM7Q9NQW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms