Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NECTIN3Q9NQS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NECTIN3Q9NQS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms