Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PFDN4Q9NQP4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms