Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCSER2Q9H7U1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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