Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABDQ9H4I3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABDQ9H4I3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms