Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNMDQ9H2S6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNMDQ9H2S6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNMDQ9H2S6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms