Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRMDAQ9H2I8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRMDAQ9H2I8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms