Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC68Q9H2F9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC68Q9H2F9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC68Q9H2F9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms