Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AMBRA1Q9C0C7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AMBRA1Q9C0C7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms