Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRCC1Q9C099 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRCC1Q9C099 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRCC1Q9C099 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRCC1Q9C099 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRCC1Q9C099 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms