Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM5Q9C035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM5Q9C035 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM5Q9C035 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms