Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCO2Q9BYV7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCO2Q9BYV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCO2Q9BYV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms