Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBCK1Q9BYM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBCK1Q9BYM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBCK1Q9BYM8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms