Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC8Q9BY41 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC8Q9BY41 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms