Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS2Q9BVG9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms