Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT11Q9BT88 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT11Q9BT88 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms