Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NICN1Q9BSH3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NICN1Q9BSH3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NICN1Q9BSH3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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