Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD2LQ9BRP1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCD2LQ9BRP1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD2LQ9BRP1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms