Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUSP9Q99956 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUSP9Q99956 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUSP9Q99956 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms