Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARD1Q99728 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARD1Q99728 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms