Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX2Q99697 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX2Q99697 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms