Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC38A3Q99624 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms