Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN3Q96TC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN3Q96TC7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms