Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK5RAP2Q96SN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK5RAP2Q96SN8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms