Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RILPQ96NA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RILPQ96NA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RILPQ96NA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms