Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms