Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC12Q96J65 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC12Q96J65 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms