Protein–RNA interactions for Protein: Q96FL8

SLC47A1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1Q96FL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC47A1Q96FL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC47A1Q96FL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC47A1Q96FL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms