Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNFT2Q96EX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNFT2Q96EX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNFT2Q96EX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms