Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC126Q96EE4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC126Q96EE4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms